Содержание
CORDA Монтажные подмости, рабочая высота 4 м
Техническая информация
Особенности продукта
Примеры использования
Похожие продукты
Аксессуары и запчасти
Скачать
Техническая информация
Универсальная рабочая платформа. Собирается легко и быстро без инструмента. Максимальная рабочая высота 4 м.
Описание:
- Нескользящие водоотталкивающая площадка 1,50м х 0,56м
- Две широкие траверсы для стабильности
- Может также использоваться на лестнице
- Максимальная нагрузка на помост 150 кг/м2
- Продукт сертифицирован в строгом соответствии с ГОСТ Р 58752-2019
Серия:
Рабочая высота:
4,00 м
5,00 м
Техн. информация:
A ≈ | м | 4,00 | 5,00 | |
B ≈ | м | 2,00 | 3,00 | |
C ≈ | м | 3,10 | 4,20 | |
Площадь установки | м | 1,55 x 1,30 | 1,60 x 1,30 | |
Вес | кг | 27,50 | 48,00 | |
Ширина (B) | м | 0,57 | 0,57 | |
Глубина (T) | м | 0,22 | 0,28 | |
Длина (L) | м | 2,16 | 2,26 | |
Арт. № | 916280 | 916129 |
Сертификация:
Особенности продукта
Примеры использования
Похожие продукты
Аксессуары
Запчасти
Скачать
Загрузить Инструкция по монтажу и применению 1
Общий каталог продукции KRAUSE
CORDA Монтажные подмости, рабочая высота 5 м
Техническая информация
Особенности продукта
Примеры использования
Похожие продукты
Аксессуары и запчасти
Скачать
Техническая информация
Универсальная рабочая платформа. Собирается легко и быстро без инструмента. Максимальная рабочая высота 5 м.
Описание:
- Нескользящие водоотталкивающая площадка 1,50м х 0,56м
- Две широкие траверсы для стабильности
- Может также использоваться на лестнице
- Максимальная нагрузка на помост 150 кг/м2
- Продукт сертифицирован в строгом соответствии с ГОСТ Р 58752-2019
Серия:
Рабочая высота:
4,00 м
5,00 м
Техн. информация:
A ≈ | м | 4,00 | 5,00 | |
B ≈ | м | 2,00 | 3,00 | |
C ≈ | м | 3,10 | 4,20 | |
Площадь установки | м | 1,55 x 1,30 | 1,60 x 1,30 | |
Вес | кг | 27,50 | 48,00 | |
Ширина (B) | м | 0,57 | 0,57 | |
Глубина (T) | м | 0,22 | 0,28 | |
Длина (L) | м | 2,16 | 2,26 | |
Арт. № | 916280 | 916129 |
Сертификация:
Особенности продукта
Примеры использования
Похожие продукты
Аксессуары
Запчасти
Скачать
Загрузить Инструкция по монтажу и применению 1
Общий каталог продукции KRAUSE
Всесторонний обзор методов каркаса при сборке генома
Обзор
. 2021 сен 2;22(5):bbab033.
дои: 10.1093/биб/ббаб033.
Цзюньвэй Луо
1
, Явэй Вэй
1
, Менгна Лю
1
, Чжэнцзян Ву
1
, Сяоянь Лю
1
, Хуйминь Луо
2
, Чаокун Ян
2
Принадлежности
- 1 Колледж компьютерных наук и технологий Хэнаньского политехнического университета, Цзяозуо, Китай.
- 2 Школа компьютерной и информационной инженерии Хэнаньского университета, Кайфэн, Китай.
PMID:
33634311
DOI:
10.1093/биб/ббаб033
Обзор
Junwei Luo et al.
Кратко Биоинформ.
.
. 2021 сен 2;22(5):bbab033.
дои: 10.1093/биб/ббаб033.
Авторы
Цзюньвэй Луо
1
, Явэй Вэй
1
, Менгна Лю
1
, Чжэнцзян Ву
1
, Сяоянь Лю
1
, Хуйминь Луо
2
, Чаокун Ян
2
Принадлежности
- 1 Колледж компьютерных наук и технологий Хэнаньского политехнического университета, Цзяозуо, Китай.
- 2 Школа компьютерной и информационной инженерии Хэнаньского университета, Кайфэн, Китай.
PMID:
33634311
DOI:
10.1093/нагрудник/bbab033
Абстрактный
В области сборки генома методы каркаса позволяют получить более полный и непрерывный эталонный геном, что является краеугольным камнем геномных исследований. Методы каркасов обычно используют выравнивание между контигами и данными секвенирования (считывания) для определения ориентации и порядка среди контигов и создания более длинных каркасов, которые полезны для последующего геномного анализа. С быстрым развитием технологий высокопроизводительного секвенирования за последнее десятилетие появились различные типы считываний, особенно в секвенировании на большие расстояния, которые значительно повысили качество сборки методов каркаса. По мере увеличения числа методов построения лесов исследователям в области биологии и биоинформатики необходимо проводить углубленный анализ современных методов построения лесов. В этой статье мы сосредоточимся на трудностях построения каркасов, различиях характеристик различных видов ридов, методах, с помощью которых современные методы построения каркасов решают эти трудности, и возможностях будущих исследований. Мы надеемся, что эта работа принесет пользу при разработке новых методов каркаса и выборе подходящих методов каркаса для конкретных биологических исследований.
Ключевые слова:
выравнивания; сборка генома; долгосрочное секвенирование; строительные леса.
© Автор(ы), 2021. Опубликовано Oxford University Press. Все права защищены. Чтобы получить разрешения, отправьте электронное письмо по адресу: [email protected].
Похожие статьи
Выбор подмножества считываний глубокого секвенирования следующего поколения для сборки генома de novo с использованием платформы MapReduce.
Fang CH, Chang YJ, Chung WC, Hsieh PH, Lin CY, Ho JM.
Fang CH и соавт.
Геномика BMC. 2015;16 Дополнение 12(Приложение 12):S9. дои: 10.1186/1471-2164-16-S12-S9. Epub 2015 9 декабря.
Геномика BMC. 2015.PMID: 26678408
Бесплатная статья ЧВК.Multi-CAR: инструмент для формирования контигов с использованием нескольких ссылок.
Chen KT, Chen CJ, Shen HT, Liu CL, Huang SH, Lu CL.
Чен К.Т. и др.
Биоинформатика BMC. 2016 23 декабря; 17 (Приложение 17): 469. doi: 10.1186/s12859-016-1328-7.
Биоинформатика BMC. 2016.PMID: 28155633
Бесплатная статья ЧВК.ntLink: набор инструментов для создания каркасов и картирования сборки генома De Novo с использованием длинных чтений.
Кумб Л., Уоррен Р.Л., Вонг Дж. , Николич В., Бироль И.
Кумб Л. и соавт.
Текущий протокол. 2023 апр;3(4):e733. дои: 10.1002/cpz1.733.
Текущий протокол. 2023.PMID: 37039735
Сборка последовательности с использованием данных секвенирования следующего поколения: проблемы и решения.
Чин Ф.Ю., Леунг Х.К., Ю С.М.
Чин Ф.Ю. и соавт.
Наука Китая Life Sci. 2014 ноябрь;57(11):1140-8. doi: 10.1007/s11427-014-4752-9. Epub 2014 17 октября.
Наука Китая Life Sci. 2014.PMID: 25326069
Обзор.
Инструменты биоинформатики для сборки и анализа генома на основе секвенирования третьего поколения.
Ви Ю, Бхьян СБ, Лю Ю, Лу Дж, Ли Х, Чжао М.
Ви Ю и др.
Краткая функциональная геномика. 2019 14 февраля; 18 (1): 1-12. дои: 10.1093/bfgp/ely037.
Краткая функциональная геномика. 2019.PMID: 30462154
Обзор.
Посмотреть все похожие статьи
Цитируется
Цитогенетический скрининг племенного ядра канадских свиней с использованием недавно разработанного метода кариотипирования, называемого олиго-бэндингом.
Пуассон В., Бастьен А., Гилберт И., Кэрриер А., Прюнье Дж., Роберт С.
Пуассон В. и др.
Генет Сель Эвол. 2023 10 июля; 55 (1): 47. doi: 10.1186/s12711-023-00819-w.
Генет Сель Эвол. 2023.PMID: 37430194
Бесплатная статья ЧВК.SynBioTools: универсальное средство для поиска и выбора инструментов синтетической биологии.
Цай П., Лю С., Чжан Д., Син Х., Хань М., Лю Д., Гонг Л., Ху Ц.Н.
Кай П. и др.
Биоинформатика BMC. 2023 17 апреля; 24 (1): 152. дои: 10.1186/s12859-023-05281-5.
Биоинформатика BMC. 2023.PMID: 37069545
Бесплатная статья ЧВК.Сборка генома Rangifer tarandus на уровне хромосом и проверка выводов об эволюции оленей и быков.
Пуассон В., Прюнье Дж., Карриер А., Гилберт И., Мастромонако Г., Альберт В., Тайлон Дж., Бурре В., Друа А., Коте С.Д., Роберт К.
Пуассон В. и др.
Геномика BMC. 2023 23 марта; 24 (1): 142. дои: 10.1186/s12864-023-09189-5.
Геномика BMC. 2023.PMID: 36959567
Бесплатная статья ЧВК.Лучшие стратегии секвенирования генома для аннотации сложных семейств иммунных генов в дикой природе.
Peel E, Silver L, Brandies P, Zhu Y, Cheng Y, Hogg CJ, Belov K.
Пил Э. и др.
Гигасайнс. 2022 30 окт;11:giac100. doi: 10. 1093/gigascience/giac100.
Гигасайнс. 2022.PMID: 36310247
Бесплатная статья ЧВК.Набросок генома и мультитканевых транскриптомных сборок неотропической листовертки Phyllomedusa bahiana.
Андраде П., Лира М.Л., Зина Дж., Бастос ДФО, Брунетти А.Е., Баэта Д., Афонсу С., Брунес Т.О., Таучче ППГ, Карнейро М., Хаддад CFB, Секейра Ф.
Андраде П. и соавт.
G3 (Бетесда). 1 декабря 2022 г .; 12 (12): jkac270. doi: 10.1093/g3journal/jkac270.
G3 (Бетесда). 2022.PMID: 36205610
Бесплатная статья ЧВК.
Просмотреть все статьи «Цитируется по»
Типы публикаций
термины MeSH
Разница между контигом и каркасом
Ключевое различие между контигом и каркасом заключается в том, что контиг не имеет промежутков, в то время как каркас состоит из контигов и промежутков.
Секвенирование генома многоклеточных организмов очень сложно по сравнению с секвенированием одноклеточных организмов. Полногеномное секвенирование дробовиком — это простой и быстрый метод секвенирования генома многоклеточных геномов. Это метод, который параллельно секвенирует множество перекрывающихся фрагментов ДНК. В этом методе маленькие фрагменты собираются в более крупные фрагменты, а затем в более крупные контиги с помощью компьютера. Затем контиги собираются в каркасы и, наконец, в хромосому. Таким образом, контиг представляет собой непрерывный участок нуклеотидной последовательности, а каркас представляет собой часть генома, состоящую из контигов и пробелов. И контиг, и каркас представляют собой реконструированные геномные последовательности.
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое Contig
3. Что такое Scaffold
4. Сходства между Contig и Scaffold
5. Сравнение бок о бок — Contig и Scaffold в табличной форме
6. Резюме
Что такое Contig?
Contig представляет собой геномную последовательность. Это непрерывный участок последовательностей, состоящий из оснований A, C, G и T. Он формируется путем объединения нескольких небольших перекрывающихся фрагментов ДНК в более длинную последовательность. Проще говоря, контиг — это совокупность набора фрагментов последовательности. Создание Contig включает идентификацию перекрывающихся фрагментов последовательности на основе локальных методов сопоставления строк и выравнивания, которые определяют перекрывающиеся концы последовательностей.
Контиги не имеют пробелов. Это часть эшафота. Контиги соединяются вместе при создании каркаса. Для этого требуется дополнительная информация об относительном положении и ориентации контигов в геноме. Промежутки разделяют контиги в каркасе. По сути, сборка контигов является важным шагом в секвенировании дробовика всего генома. Наконец, контиги собираются в полную геномную последовательность. Сборка Contig обычно требует понимания алгоритмов сопоставления строк и выравнивания последовательностей.
Что такое леса?
Каркас представляет собой реконструированную геномную последовательность из клонов дробовика с полным геномом. Структурно скаффолд состоит из контигов и щелей. Следовательно, каркасы создаются путем объединения контигов в цепочку и разделения их промежутками. Для создания скаффолда нужна информация об относительном положении и ориентации контигов в геноме. Полногеномная сборка нацелена на представление каждой геномной последовательности в одном каркасе. Но это не совсем возможно. Следовательно, одна хромосома может быть представлена несколькими скаффолдами. Иногда скаффолды могут перекрываться. Кроме того, некоторые леса могут быть отфильтрованы во время сборки.
Рисунок 02: Обзор полногеномной сборки Shotgun
Длина зазора каркаса не показывает его истинную длину. Как правило, промежутки произвольно устанавливаются на определенную фиксированную длину. Следовательно, эти пробелы и неопределенность в их длине создают проблемы для понимания истинных пространственных отношений функциональных элементов в геномах и фактического объема недостающей информации. Иногда пробелы представляют собой недостающую геномную информацию.
В чем сходство между Contig и эшафотом?
- Контиг и каркас представляют собой геномные последовательности, состоящие из последовательностей нуклеотидов.
- Каркасы состоят из контигов и пробелов.
В чем разница между Contig и эшафотом?
Контиг представляет собой непрерывную последовательность, собранную из набора фрагментов последовательности. Напротив, скаффолд представляет собой часть геномной последовательности, реконструированную путем объединения контигов в цепочку. Итак, в этом ключевое различие между контигом и эшафотом. Более того, контиги не имеют пробелов, в то время как контиги в скаффолде разделены пробелами.
Ниже в инфографике приведены дополнительные различия между контигом и каркасом.